2007年10月24日，为了树立乌鲁木齐市眼耳鼻喉专科医院与和库尔勒市第二人民医院的良好社会形象，解决当地老百姓看病贵看病难问题，提高当地医疗服务的水平，挖掘和培植合作医疗机构精品专科，为当地培养出一批技术先进的中青年骨干。乌鲁木齐市眼耳鼻喉专科医院与和丰县人民医院签订了长期的医疗合作协议。
　　至今，我院合作医疗已经与12家医院签订了长期的合作协议，遍及南北疆地区，为当地老百姓带来了福音。
合作医院：
南疆地区：
轮台县人民医院
于田县人民医院
和田县人民医院
城县人民医院
巴楚县人民医院
库车县人民医院
库尔勒市第二人民医院 北疆地区：
阿勒泰医院
托里县医院
和丰县人民医院
精河县人民医院
伊犁州奎屯医院